分子生物酶缓冲液，是在分子生物酶反应体系中，防止酶失活，提高酶特异性的缓冲液。本分类下，主要包括DNA聚合酶缓冲液、连接酶缓冲液，及限制性内切酶酶切缓冲液。

    DNA聚合酶缓冲液主要应用于PCR扩增，其目的在于为DNA聚合酶提供一个最适的酶催化反应条件。目前最为常用的缓冲体系为10-50mmol/L Tris-HCl (pH8.3-8.8,20℃)， Tris是一种双极性离子缓冲液，在实际PCR中，pH变化于6.8-7.8之间。MgCl₂是PCR buffer的主要成分之一，Mg²⁺浓度大小会直接影响产物的产量，DNA聚合酶在识别dNTP以及DNA模板结合形成复合体时需要镁离子的参与。

    连接酶缓冲液(DNA Ligase Buffer)主要应用于催化双链DNA的连接反应，如连接目的片段和载体。连接酶缓冲液成分中含有ATP，ATP将为连接酶反应提供能量。二硫苏糖醇（DTT）和牛血清白蛋白（BSA）是酶保护剂，有助于酶的稳定。

    限制性内切酶酶切缓冲液，酶切实验一般分为单酶切和双酶切反应(Double Digests)，通常情况下不同的内切酶的最佳反应条件并不相同。同步双酶切是一种省时省力的常用方法，选择能让两种酶同时作用的最佳缓冲液是非常重要的一步。BSA是酶的稳定剂，可以结合缓冲液或底物DNA中抑制限制性内切酶活性的金属离子和其它化学物质。

                    NEB双酶切buffer表

特别注意：

    连接酶缓冲液中含有ATP成分，应保存于-20℃并避免反复冻融，分装使用。