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正在加载...琼脂糖
琼脂糖是线性的多聚物，基本结构是1,3连结的β-D-半乳呋喃糖和1,4连结的3,6-脱水α-L-半乳呋喃糖。琼脂糖凝胶性能通常用凝胶强度表示。强度越高，凝胶性能越好。质量较好的琼脂糖强度通常在1200克/cm2以上（1%胶浓度）。琼脂糖具有亲水性，并几乎完全不存在带电基团，对敏感的生物大分子极少引起变性和吸附，是理想的惰性载体。
琼脂糖分类及分辨DNA分子大小的范围
市售的琼脂糖根据熔化温度不同，可分为标准熔点琼脂糖和低熔点琼脂糖。
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琼脂糖类型 |
凝结温度 |
熔化温度 |
商品名 |
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标准琼脂糖 |
从Gelidium spp分离Low EEO |
35~38℃ |
90~95℃ |
SeaKem LE Agrose LE Low EEO Agrose Molecular Biology Certified Grad |
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从Gracilaria spp分离Low EEO |
40~42℃ |
85~90℃ |
SeaKem HGT Agrose HGT |
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高EEO |
34~38℃ |
~95℃ |
Seakem HEEO Agrose high EEO |
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高强度 |
34~43℃ |
85~95℃ |
FastLane SeaKem Gold Chromosomal Grade Agrose |
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低熔点/凝点琼脂糖 |
低熔点 |
25~35℃ |
63~65℃ |
SeaPlaque |
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35℃ |
65℃ |
Nusieve |
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超低熔点 |
8~15℃ |
40~45℃ |
SeaPrep |
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低粘性低熔点
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25~30℃ |
70℃ |
InCert |
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38℃ |
85℃ |
Nusieve3:1 |
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30℃ |
75℃ |
Agrose HS |
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各种类型琼脂糖分辨DNA分子大小的范围 |
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琼脂糖% |
标准熔点 |
高强度 |
低熔点 |
低粘性低熔点 |
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0.3 |
700bp~25kb |
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|
0.5 |
500bp~15kb |
|
|
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|
0.8 |
250bp~12kb |
800bp~10kb |
800bp~10kb |
|
|
1.0 |
150bp~6kb |
400bp~8kb |
400bp~8kb |
|
|
1.2 |
80bp~4kb |
300bp~7kb |
300bp~7kb |
|
|
1.5 |
|
200bp~4kb |
200bp~4kb |
|
|
2.0 |
|
100bp~3kb |
100bp~3kb |
|
|
3.0 |
|
|
500bp~1kb |
500bp~1kb |
|
4.0 |
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|
100bp~500bp |
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6.0 |
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10bp~100bp |
选择琼脂糖注意事项
在琼脂糖凝胶中，核酸向阳极迁移的速度受到电内渗的影响。这个作用由于离子化的酸性基团（通常是硫酸盐）附着到琼脂糖凝胶的多糖基质引起的。酸性基团导致缓冲液中产生正电荷反向离子，它们向阴极迁移，从而造成与DNA反方向迁移的液流。
琼脂糖中负电荷密度越高，EEO流越大，并且核酸片段的分离越差。小片段DNA（<10kb）的延迟效应不明显，但是较大的DNA却十分明显，尤其在PFGE时。为避免此类问题，最好使用低水平EEO的琼脂糖。
有关琼脂糖的应用请参考：http://122.193.26.230/appcat.php?mod=view&id=171
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